Text
UJI AKTIVITAS ANTIVIRUS SENYAWA DALAM TANAMAN AKAR WANGI (Vertiveria zizonoides (L.) Nash.) PADA RESEPTOR VIRUS SARS-CoV-2 (COVID-19) SECARA IN SILICO
Awal tahun 2020, ditemukan penyakit menular yang disebabkan oleh virus corona
jenis baru, yang oleh World Health Organization diberi nama Coronavirus Disease
2019 (COVID-19) yang disebabkan oleh Severe Acute Respiratory Syndrome
Coronavirus-2 (SARS-CoV-2). Penemuan obat baru saat ini dapat dilakukan secara
efektif dan efisien, salah satunya penelitian dengan menggunakan metode in silico.
Penelitian ini bertujuan untuk memperoleh kandidat senyawa aktif dari tanaman akar
wangi yang memiliki aktivitas antivirus pada reseptor virus SARS-CoV-2 serta dapat
mevisualisasikan interaksinya. Banyak tanaman di Indonesia yang secara empiris
digunakan sebagai antivirus. Salah satu tanaman yang mudah dan banyak dijumpai di
Indonesia adalah tanaman akar wangi (Vertiveria zizonioides (L.) Nash). Senyawa
yang dikandung dalam tanaman akar wangi pada penelitian ini digunakan ligand uji
pada reseptor virus SARS-CoV-2. Dalam penelitian ini menggunakan 25 resptor
yang diambil dari Protein Data Bank yang merupakan protein dari virus SARS-CoV2
dan melalui proses validasi protein serta mencari nilai RMSD-nya menggunakan
aplikasi PLANTS dan YASARA, didapatkan yang memenuhi syarat untuk
digunakan, yaitu protein dengan kode 5R7Y, 5R7Z, 5R84, 5R84, 6M17, dan 6VYO.
Afinitas senyawa dalam akar wangi dibandingkan dengan afinitas native ligand dan
senyawa pembanding (favipiravir dan remdesivir), diperoleh senyawa elaidamide,
junipene, khusimol, epiglobulol, spathulenol, dan squalane yang mempunyai afinitas paling
baik. Kemudia dilakukan visualiasi menggunakan aplikasi VMD dan diperoleh asam amino
yang berperan aktif pada ikatan terhadap reseptor adalah alanine, serine, phenylalanine,
valine, tyrosine, dan isoleucine
Tidak tersedia versi lain