Text
PENAPISAN VIRTUAL SENYAWA DALAM TANAMAN FAMILI PIPERACEAE SEBAGAI LIGAN PADA ESTROGEN ALFA (ER-α)
ABSTRAK
(A) RODELAIDE (2012210231)
(B) PENAPISAN VIRTUAL SENYAWA DALAM TANAMAN FAMILI
PIPERACEAE SEBAGAI LIGAN PADA ESTROGEN ALFA (ER-α)
(C) xvi + 101 halaman; 6 tabel; 13 gambar; 9 lampiran
(D) Kata kunci: Penapisan Virtual, famili Piperaceae, Reseptor Estrogen Alfa
(ER-α)
(E) Famili Piperaceae terdiri dari kurang lebih 3.600 spesies yang saat ini terbagi
dalam 13 genus. Beberapa tanaman famili Piperaceae diketahui memiliki
aktivitas sebagai anti-kanker payudara. Pada penelitian ini dilakukan
penapisan virtual struktur 2D senyawa dari beberapa tanaman famili
Piperaceae yaitu Piper nigrum L, Piper methysticum, Piper cubeba L. f.,
Piper betle L, dan Piper longum L. Tujuan penelitian ini adalah untuk
menganalisis dan memperoleh kandidat senyawa yang aktif sebagai ligan
pada ER-α dengan menggunakan protokol penapisan virtual tervalidasi Anita
et al (2012) yang selanjutnya akan dilakukan elusidasi moda ikatan senyawa
representatif aktif untuk melihat interaksi asam-asam amino pada binding site
senyawa tersebut. Protokol ini menggunakan sistem operasi Linux Ubuntu
10.04 LTS dengan aplikasi terintegrasi seperti SPORES, PLANTS 1.2,
BKChem, Open Babel, R Computational Statistic dan PyMOL, senyawa
pembanding 2-(4-hidroksi-fenil)-1-(4-pirolidin-1-il-butil)-1H-indol-5-ol atau
ZINC 01914469, senyawa rujukan 4-[4-hidroksi-3-(prop-2-en-1-il) fenil]-2-
(prop-2-en-1-il) (senyawa dimer nomor 11 atau ZINC 01688147) dan
senyawa 4-hidroksitamoksifen sebagai kontrol positif. Hasil penapisan virtual
yang dilakukan terhadap 110 senyawa dari lima tanaman famili Piperaceae
diperoleh 2 senyawa yang dinilai aktif oleh senyawa pembanding dan 39
senyawa yang dinilai aktif oleh senyawa rujukan .Empat residu asam amino
yang dinilai berperan penting terhadap afinitas antara senyawa dan ER-α
yaitu GLU353, ARG394, ASP351 dan THR347.
(F) Daftar rujukan : 34 buah (1995-2016)
(G) Dr. Esti Mumpuni, M.Si., Apt.
(H) 2017
Tidak tersedia versi lain