Text
SKRINING TANAMAN VIRTUAL SENYAWA DALAM TANAMAN FAMILIA AMARANTHACEAE SEBAGAI LIGAN PADA RESEPTOR SIKLOOKSIGENASE EE-2 MENGGUNAKAN PROTOKOL EE_COX2_V.1.0
ABSTRAK
(A) RADITYO RACHMAD MAS (2013210188)
(B) SKRINING VIRTUAL SENYAWA DALAM TANAMAN FAMILIA AMARANTHACEAE SEBAGAI LIGAN PADA RESEPTOR SIKLOOKSIGENASE-2 MENGGUNAKAN PROTOKOL EE_COX2_V.1.0
(C) xx + 101 halaman; 12 tabel; 35 gambar; 7 lampiran
(D) Kata Kunci : familia Amaranthaceae, anti inflamasi, skrining virtual siklooksigenase-2 (COX-2), EE_COX2_V.1.0, score ChemPLP
(E) Beberapa penelitian mengenai familia Amaranthaceae yang berpotensi sebagai anti-inflamasi dan anti-kanker telah dipublikasi sebelumnya. Mengacu pada berbagai hasil penelitian tersebut, pada penelitian ini dilakukan skrining virtual dan elusidasi moda ikatan terhadap 42 senyawa bahan alam yang berasal dari 15 spesies familia amaranthaceae menggunakan protokol EE_COX2_V.1.0. Penelitian ini bertujuan untuk mengetahui ligan pembanding ZINC03814661 sebagai ligan modifikasi apakah dapat digunakan sebagai pembanding pada protokol tervalidasi EE_COX2_V.1.0. dan untuk mendapatkan kandidat senyawa yang aktif sebagai penghambat selektif siklooksigenase-2 (COX-2). Berdasarlam skor ChemPLP senyawa aktif yang terkandung dalam tanaman familia Amaranthaceae yang dapat menjadi ligan dari reseptor COX-2 pada protokol EE_COX2_V.1.0 adalah asam oleat, asam folat, asam kafeat, p-asam kumarat, asam fumarat, saponin pfaffiat, amarantin, triterpenoid saponin, betain, linoleat, dan fitol. Berdasarkan proses elusidasi moda ikatan yang dilakukan terhadap 11 senyawa yang aktif didapatkan 3 asam amino dari reseptor yang berinteraksi dengan senyawa uji maupun dengan ligan ZINC03814547 dan ligan ZINC03814661. Asam amino tersebut adalah ARGININ106 (ARG106), GLYSIN (GLY512), dan PHENYLALANIN515 (PHE515).\
(F) Daftar rujukan : 39 buah
(G) Dr. Esti Mumpuni, M.Si, Apt.
(H) 2017
Tidak tersedia versi lain