Text
PENAMBATAN MOLEKUL GLUKOMANAN PADA RESEPTOR TERKAIT SISTEM IMUN SELULER DAN HUMORAL
Glukomannan merupakan polisakarida dari jenis hemiselulosa yang terdiri dari ikatan
rantai galaktosa, glukosa, dan mannosa. Aktivitasnya sebagai senyawa
imunomodulator telah banyak diteliti dengan penelitian lain baik secara in vivo
maupun in vitro. Penelitian ini bertujuan untuk melihat interaksi molekuler senyawa
glukomanan pada beberapa reseptor imun reseptor TNF-α, reseptor sel T, reseptor
Interleukin-10 dan Toll Like Receptor 3 (TLR-3) dengan metode molecular docking.
Penelitian ini menggunakan aplikasi diantaranya Marvinsketch akan digunakan
untuk menggambar struktur ligan, Molegro Virtual Docker versi 7 digunakan
untuk preparasi ligan atau senyawa, preparasi protein yang akan digunakan dan
untuk melakukan proses docking. Aplikasi Pymol digunakan untuk visualisasi
kompleks ligan dengan reseptor. Proses Homology modelling akan dilakukan
dengan webserver I-Tasser, webserver SwissModel dan webserver Modeller
untuk pencetakan struktur protein tiga dimensi yang akan digunakan dalam
penelitian dan aplikasi Procheck untuk melakukan validasi hasil homology
modelling. Hasil docking reseptor terhadap ligan uji dinyatakan dalam nilai rerank
score. Pada penelitian ini, senyawa uji yaitu glukomannan memiliki rerank score lebih
rendah dibandingkan dengan senyawa pembanding yaitu thalidomide, ofatumumab
dan poly i:c dengan rerank score glukomannan -95.684 Kkal/mol ; thalidomide 69.9112
Kkal/mol, glukomannan -75.5762 Kkal/mol ; ofatumumab -59.684
Kkal/mol, dan glukomannan -62.6283 Kkal/mol ; Poly i:c -36.4788 Kkal/mol.
Kesimpulan dari penelitian ini adalah senyawa glukomannan memiliki afinitas yang
sama atau jauh lebih baik sebagai senyawa imunomodulator dari senyawa
pembanding.
Tidak tersedia versi lain