Text
PENAPISAN VIRTUAL SENYAWA DALAM TANAMAN FAMILI FABACEAE SEBAGAI LIGAN PADA RESEPTOR ESTROGEN ALFA (ER-α)
ABSTRAKrn(A) LINA HIDAYANTI GULO (2011210133)rn(B) PENAPISAN VIRTUAL SENYAWA DALAM TANAMAN FAMILI rnFABACEAE SEBAGAI LIGAN PADA RESEPTOR ESTROGEN ALFA (ER-α)rn(C) xv + 90 halaman; 8 tabel; 29 gambar; 6 lampiran.rn(D) Kata kunci: famili Fabaceae, penapisan virtual, reseptor estrogen alfa (ER- α).rn(E) Famili Fabaceae memiliki sekitar 730 genus dan 19.400 spesies. Beberapa rntanaman famili Fabaceae diketahui memiliki aktivitas sebagai anti-kanker rnpayudara. Pada penelitian ini dilakukan pemanfaatan metode kimia komputasirn(computational chemistry) secara penapisan virtual atau penapisan in silicornterhadap senyawa-senyawa dalam tanaman famili Fabaceae yaitu Abrus rnschimperi, Caesalpinia bonduc, Dalbergia vacciniifolia, Eriosema robustum, rnErythrina falcata, Flemingia macrophylla, Genista saharae, Trifolium pratensernL., Pachyrhizus erosus, Pissum sativum dan DNP (Dictionary of Natural rnProducts). Tujuan penelitian ini adalah untuk mencari kandidat senyawa tersebut rnsebagai ligan yang aktif pada reseptor estrogen alfa (ER-α) secara in silico serta rnmengelusidasi asam amino yang terdapat pada binding site senyawa tersebut rndengan menggunakan protokol penapisan virtual tervalidasi Anita et al (2012).rnProtokol ini menggunakan sistem operasi Linux Ubuntu 14.04 LTS dengan rnaplikasi terintegrasi seperti SPORES, PLANTS 1.2, BKChem, Open Babel, R rnComputational Statistic dan PyMOL, senyawa pembanding ZINC 01914469, rnsenyawa rujukan 4-[4-hidroksi-3-(prop-2-en-1-il) fenil]-2-(prop-2-en-1-il) rn(senyawa dimer nomor 11) dan senyawa 4-hidroksitamoksifen sebagai kontrol rnpositif. Hasil penapisan virtual yang dilakukan terhadap 60 senyawa dari sepuluh rntanaman famili Fabaceae diperoleh 24 senyawa yang dinilai aktif dan 38 rnsenyawa tidak aktif pada binding pocket ER-α. Asam amino yang berperan rnpenting terhadap afinitas senyawa uji dengan reseptor estrogen alfa (ER-α) yaitu rnGLU353, ARG394, ASP351 dan THR347.rn(F) Daftar rujukan: 30 buah (2004-2014)rn(G) Dra. Esti Mumpuni, M.Si., Aptrn(H) 2015
Tidak tersedia versi lain